К компетенции Правительства Республики Казахстан относятся:

1) разработка основных направлений государственной политики в сфере создания и функционирования специальных экономических и индустриальных зон;

2) принятие решения:

о создании специальной экономической зоны, включая определение ее целей, утверждение положения о ней и целевых индикаторов;

о продлении срока функционирования специальной экономической зоны с установлением условий такого продления;

об упразднении специальной экономической зоны;

о создании или определении управляющей компании специальной экономической зоны или индустриальной зоны республиканского значения;

3) определение единого координационного центра;

4) определение типовых функций регионального координационного совета;

5) определение порядка отбора проектов, реализуемых участниками специальных экономических зон, в отношении которых могут применяться международные, региональные стандарты и стандарты иностранных государств;

6) выполнение иных функций, возложенных на него Конституцией, настоящим Законом, иными законами Республики Казахстан и актами Президента Республики Казахстан.