В компетенцию отраслевого уполномоченного органа входят:

1) участие в разработке предложений и реализации государственной политики в области науки и научно-технической деятельности, координация работы по проведению научных исследований в соответствующей отрасли;

2) участие в формировании приоритетных направлений фундаментальных и прикладных научных исследований в соответствующей отрасли;

3) организация разработки научных, научно-технических проектов и программ, финансируемых из государственного бюджета, и осуществления их реализации в соответствующей отрасли;

4) утверждение отчетов по выполненным научным, научно-техническим проектам и программам в соответствующей отрасли, финансируемым из государственного бюджета;

5) внесение в уполномоченный орган предложений по кандидатурам для включения в состав национальных научных советов;

6) внесение в уполномоченный орган предложений по формированию перечня субъектов базового финансирования;

7) осуществление иных полномочий, предусмотренных настоящим Законом, иными законами Республики Казахстан, актами Президента Республики Казахстан и Правительства Республики Казахстан.