Государственным органом, осуществляющим контроль за соблюдением законов, правил и процедур, обеспечивающих защиту гражданской авиации Республики Казахстан от актов незаконного вмешательства, является Государственная комиссия по авиационной безопасности гражданской авиации. Государственная комиссия разрабатывает государственную политику по авиационной безопасности, реализует Программу авиационной безопасности, вытекающую из обязательств государства по конвенциям Международной гражданской авиации (ИКАО).

Эксплуатанты воздушных судов, организации и граждане, осуществляющие прием, выпуск или обслуживание воздушных судов, обязаны принимать меры по защите авиации от незаконного вмешательства в ее деятельность в соответствии с правилами авиационной безопасности, устанавливаемыми Государственной комиссией по авиационной безопасности гражданской авиации.

Защита авиации от незаконного вмешательства в ее деятельность обеспечивается:

1) предотвращением доступа посторонних лиц и транспорта в контролируемую зону аэропорта;

2) охраной воздушных судов на стоянках, исключающей возможность проникновения в воздушные суда посторонних лиц;

3) исключением возможности незаконного провоза оружия, боеприпасов, взрывчатых, радиоактивных, отравляющих, легковоспламеняющихся и других опасных веществ и предметов, запрещенных к перевозкам воздушным транспортом;

4) введением особых мер предосторожности при перевозке оружия и боеприпасов, обеспечивающих их перевозку в багаже в разряженном состоянии, в изолированных от пассажиров отсеках воздушных судов;

5) специальными досмотрами воздушных судов в особых случаях;

6) оснащением воздушных судов техническими устройствами, обеспечивающими безопасную работу экипажей в полете, а также исключающими противоправное использование воздушного судна;

7) специально разработанными центральным исполнительным органом на транспорте мерами противодействия незаконному вмешательству в деятельность авиации, а также и другими мерами, обеспечивающими авиационную безопасность.